המים באמבטיית קרח צריכים סינון איכותי כי הם לא מוחלפים בתדירות גבוהה, על מנת לחסוך החלפות מים והוצאות מיותרות, מומלץ לשים לגיגית או אמבטיית קרח שמשתמשים בה באופן קבוע, פילטר שידאג לשמור על המים נקיים לאורך זמן גם בשימוש אינטנסיבי.
הסינון צריך להיות עם מרכיב מכאני, משמע ספוג שיעצור את הלכלוכים ובמקרים בהם המים נמצאים באור שמש או שהם מפתחים ירוקת, מומלץ להוסיף מערכת UV.
ישנם פילטרים פנימיים שמגיעים עם מערכת UV מובנית וככה מטפלים בנושא בצורה היסודית ביותר.
פילטר פנימי יהיה בתוך המים, פילטר חיצוני יהיה מחוץ למים אך צריך לשים לב שהוא מתאים כי רוב הפילטרים מיודעים לאקווריומים והם יושבים מתחת לגובה פני המים (מתחת לאקווריום) ובאמבטיות קרח הפילטר יושב בגובה המים על הרצפה ברוב המקרים.
